涉农补贴，是国家惠农强农的重要措施。涉农补贴以财政为主体，以金融部门为支撑点，以国家的有关政策为依据建立了操作平台，即涉农补贴“一折通”。其主要特点是快捷、方便、资金安全可靠、补贴项目清晰，便于补贴对象了解补贴情况，便于上级监督检查。正是“一折通”的上述优点，凡涉及农业、农民的补贴资金全部通过“一折通”发放，使“一折通”发放的范围越来越广、项目越来越多。如粮食直接补贴、小麦综合、水稻综合、小麦良种、母猪补贴、农机补贴、家电下乡、特困群众、学生补贴、库区移民、抚恤优抚等20多项。做好惠农补贴工作是一项长期、复杂、艰巨的工作，当前，这项工作中仍然存在一些不容忽视的问题。
起步晚补贴总量低
对农业进行补贴以稳定粮食生产、促进农业增收是发达国家常用的做法，美国、日本、新加坡等农业发达国家早在18世纪初就对农业种植业、养殖业进行大比例补贴；对农业机械给予补贴和优惠贷款，大幅度提高农业生产力；鼓励种粮能手承包大面积土地，以便集约化经营；特别是对农业科研部门进行科研经费投入，以优化种子、提高单产，保证粮食总量的增长。
目前，由于中央财政投入不足，涉农补贴的大部分项目要地方配套，当地方财政周转困难时，导致补贴投入不足或不能按时发放，一些项目补贴偏低。其一，粮食直接补贴，每亩10元钱偏低，而且以计税地亩为补贴依据，不能覆盖全部种植面积；其二，“五保户”每人每月补助100元显然不能满足“五保户”的生活需要。
部门不协调增加发放难题
涉农补贴工作牵涉到财政、农业、农机、民政、教育、人口计生、金融、保险等多个部门和行业。政出多门，各部门按照自己对政策的理解去办事，没有统一的规划，往往形成步调不一、理解不同的不利局面。由于党委、政府高度重视惠农补贴工作，对补贴发放的时限做了具体的规定，最长的是5个工作日，特急项目1个工作日。各部门必须在规定的时限内完成自己的工作，有的部门便草率的下文，尽快把“球”踢到下一个部门，当下一个部门操作困难时，下文部门却本着“事不关己，坚决不理”的态度，缺乏责任意识和为民办实事的精神。有的部门头天下文件，第二天就下村督查，犹如“这边熄灯，那边吹号”，看似积极，实则添乱。对于地亩较少的农户，补贴并不多，公证费用加上差旅费也是一笔不小的开支，农户往往置之不理。
按照“一折通”的要求是一户一折，不准出现一户多折的现象，也就是说，不论什么项目，只要是这一户中的某一人享受的补贴都打入同一个“一折通”，这就要求发放信息不但要提供享受人的姓名，还要提供户主姓名和“一折通”账号及户主编码，但有些部门提供的补贴信息就不尽完善，如“学生两免一补”、“重度残疾人”补贴这两个项目，主管部门提供了享受人姓名、监护人、户主编码，有的学生把监护人填上了自己爷爷、母亲的名字，而“一折通”户主往往都是父亲的名字，导致户主编码与姓名不符，难以发放，要浪费大量的时间去核对。
技术问题影响发放质量
主要是软件问题。一是财政部门使用的“一折通”软件问题，目前财政部门使用的“一折通”发放软件，不能进行累计查询，哪个月发放了什么项目必须到那个月进行查询，在其他月份查不到这个项目。二是金融部门使用的软件问题，金融部门使用的软件可打印的汉字不多，表述不明晰，不便于农民查询和理解，查看农民的“一折通”，收入项目里只有“农补”、“综补”等字样，应该把国家补贴的项目完整地打印在收入项目里，让农民心里明白。
行业规则问题给农民带来麻烦
常言道“行有行规”，涉农补贴同样遇到了这样的问题。其一，有的农户“一折通”本子丢失或被盗，他们首先向财政部门报告，财政部门应该立即冻结这个账户，并查询该账户的余额，看一看被盗取的数额多少。但是，金融部门规定为储户保密，外人不得查询，必须由本人持身份证到原开户的金融单位挂失。有的农户在外地打工，不能及时回家，错失了挂失或报案的机会，造成不应有的损失。其二，农村“五保户”都是高龄人群，大都行动不便，有的已经丧失了行动能力，由本人持身份证到金融部门提款不现实，应该允许村组干部代为办理。
