长江证券研报指出，农业供给侧结构性改革出台的原因或在于制度缺陷、部分产品供需失衡、农产品供给效率偏低，以及粮食安全问题严峻：从制度上来看，我国土地经营权流转改革进程较慢，造成农民进城务工后农村耕地闲置率达到15%；部分农产品存在较为严重的供需失衡，玉米供给严重过剩，加之大豆供给严重不足并存；农产品供给效率偏低，亟待提升；农村环境污染，土壤污染越来越严重，粮食安全问题严峻。
调结构、提效率、增收入
2016年12月19日~20日于北京召开的中央农村工作会议强调，推进农业供给侧结构性改革，关键在完善体制、创新机制，加快深化农村改革，理顺政府和市场的关系，全面激活市场、激活要素、激活主体。推进粮食等重要农产品价格形成机制和收储制度改革，深化农村产权制度改革，改革财政支农投入使用机制，加快农村金融创新，健全农村创业创新机制。
华创证券一位不愿具名的分析师告诉《每日经济新闻》记者，因为目前农产品的产量是过剩的，所以供给侧结构性改革主要的目的是注重质量；其次，希望国内农产品的成本能够下降，然后去与国外接轨，具备国际市场的竞争力；最后则是不同产业的融合。
上述分析师指出，水稻和小麦从2017年来看影响应该不大，但玉米在今年肯定会做一些改革，国家肯定会减少玉米的种植面积，目的就是到2020年玉米的种植面积会达到5亿亩左右；另一方面，国家也希望给深加工企业比较多的补贴，进而把两亿多吨的库存消化掉。
“目前来看农业供给侧结构性改革对供需关系的影响不会太大，供给侧结构性改革最终的想法应该是通过土地流转来扩大种植规模，但这也应该是一个长期的过程。同时，种植规模的提升肯定是会有利于种业、化肥等这样的企业。但就目前来看，农业供给侧结构性改革对公司业绩的影响还看不到。”上述分析师说道。
招商证券的一位农业分析师则向《每日经济新闻》记者表示，农业供给侧结构性改革，第一是调整种植结构——过去玉米的种植面积“侵占”了大豆的种植面积，从而导致国内玉米的产量高、进口高和库存高的“三高”问题，现在通过玉米价格下跌的方式使得农户自发地放弃种植玉米，改种大豆或者其他粮食，从而达到调整种植结构、缓解国内库存压力的目的。第二，供给侧结构性改革未来将推动国内农业生产效率的提升、提高农民收入，一方面是通过规模化的种植，提升每个农户种地的面积；另一方面则是提升农产品的品质，从而提升价格，通过“优质优价”来提高农民收益。
分析师：看好农业深加工企业
2016年12月的行情都围绕“农业供给侧结构性改革”展开，而与以往的概念炒作相比，今年政府更注重农业供给侧结构性改革的力度和政策。从中央经济工作会议到农村工作经济会议，都说明农业供给侧结构性改革不仅将是短期性的机会，还很有可能演变为今年的投资主线。
中泰证券在研报中指出，种植链、饲料、禽链、农产品等农业子板块都将直接受益于农业供给侧结构性改革。以种植链为例，其改革主要体现在种植产业的结构调整，推动种植业生产方式的变革，部分种植效率低下、种植成本高的散户将被迫退出，而种植大户、家庭农场、农村合作社和农业产业化龙头企业等新兴农业生产主体的快速崛起，将带动我国农业现代化快速推进，并倒逼上游的种业和农垦的市场化改革加速。
《每日经济新闻》记者注意到，农业的行业巨头兼并重组已经开始。上周，经过国务院批准，中储粮总公司和中储棉总公司实施重组，中储棉总公司无偿划转并入中储粮总公司，成为其全资子公司，重组后的中储粮将成为国内最大的农产品企业集团，进一步增强国家农产品宏观调控能力。
上述华创证券分析师告诉《每日经济新闻》记者，“其实我认为农业供给侧结构性改革是一个炒作概念，现在这个时间点还比较难说投资机会。每年的农村工作会议召开前，市场都会开始炒作。然后在次年1月底或者2月初《一号文件》出台后就会出现卖点。但从原来市场的观点来看，市场还是比较偏好种植方面，例如登海种业（002041）、北大荒（600598）和中粮生化（000930）等这类深加工的企业。但作为投资者来讲，还是希望今后看到公司业绩得到改善。”
前述招商证券分析师则认为，规模化的种植，如种子、农垦等这种生产原料提供商集中度的提升，未来会是一个不错的投资机会。例如国内的种业、农垦龙头企业，隆平高科（000998）、登海种业、北大荒等；另外，对于“优质优价”的农业细分领域来说，未来在资源整合方面有能力，以及做中端品牌农业的企业，也就是全产业的企业会相对有一些优势。
