新疆农科城是由科技部和自治区联合推动的一项重大科技工程，于2014年8月正式启动建设，总部设在昌吉国家农业科技园区科技大厦，目前已被纳入丝绸之路经济带创新驱动发展试验区建设重要任务。
“一城一联盟一基金”是新疆农科城建设的总体格局。“一城”是农科城的功能区，并非物理空间意义上的城市实体，是以总部为载体，以我区现有国家、自治区级农业科技园区建设为依托，借助信息、科技、金融、产业合作等网联平台构建的一个虚拟化的社会化组织，
据介绍，经过两年多时间的建设，“一城”已高规格、高标准搭建了组织架构，《新疆国家现代农业科技城建设方案》已获科技部正式批准实施，目前新疆农科城已被批准为国家首批现代农业科技示范区。
一个联盟是丝绸之路农业科技园区协同创新战略联盟。2016年12月29日，我区38家国家、自治区级农业科技园区，联合组建了这一联盟，这是农科城建设过程中的一项标志性成果。一个基金是新疆农科城投资基金和种业基金等农业科技基金群。据了解，这一基金将于近期筹建。
“新疆农科城建设在机制探索、创新平台建设、创新品牌培育方面取得了重要的阶段性进展，得到了科技部的认可。挂牌后，农科城可以更大程度地发挥示范引领作用，激发和释放新疆农业发展新活力。”自治区科技厅副厅长高旺盛说。
