记者在采访中了解到，有机肥生产的基本原理就是把粪尿等有机物料与木糠、秸秆碎等混合，进行自然发酵或添加微生物好氧发酵，将有机质转化为稳定腐殖质的过程。不同的清粪方式和处理规模，方法略有不同。
要做有机肥先改掉水泡粪
水分是有机肥生产中一项重要指标。因此，干清粪方式更适合生产有机肥。河源东瑞肥料有限公司技术经理李有建告诉记者，堆肥发酵的第一步就是调水分，最适合的水分是50%-60%,过干或过湿都会影响好氧发酵过程。如果以一头肥猪年产396公斤猪粪计算，干清粪的利用率能达到70%-80%,而水泡粪或水冲粪再固液分离出来的猪粪含水量高，利用率不到50%.而且养分溶于水，也降低了肥效，降低生产有机肥的价值。
据华南农业大学资源环境学院王德汉教授介绍，水泡粪方式固液难分离，即使分离，猪粪养分流失，肥效低。因此一些水泡粪的猪场已经改造成水冲粪模式。
如何把水泡粪或水冲粪方式直接改造成干清粪，记者暂时还没有找到案例。但据了解，一些猪场通过安装简易的猪厕所，来训练猪只定点排便，可以进一步减少冲栏用水量，也不失为一种好办法。
“高床发酵型生态养猪模式”直接将猪舍与有机肥生产车间相结合，粪尿一起处理，更加节约场地和人力物力。猪舍两层结构，二层养猪采用温控通风设备，全漏缝地板结构，养猪生产过程中不冲水、产生的猪粪尿通过漏缝板落入一层垫料中；猪舍一层高度为2.5-2.8m,铺设木糠等垫料消纳猪粪尿，垫料厚度60-70cm,翻堆机自动翻堆，初步发酵半腐熟有机肥，再转移到有机肥车间进一步发酵。
好氧发酵是核心
粪便收集起来之后，就要进行堆肥发酵了，这里也有一些门道。李有建表示，首先要通过添加高含碳、低含水份的辅料，把水份和C/N比调节到合适的比例。然后，根据猪场规模和场地选择发酵方式。完整的堆肥发酵包括升温期、高温期、降温腐熟期三个阶段。一般猪场简易情况下，主要进行高温期，通过好氧发酵杀灭虫卵等以达到无害化目的。好氧发酵需要不断翻堆，有条件的猪场可以使用通风设备，这个过程通常需要20天。
陈化时间可长可短，期间每周翻堆一次。但有机肥是有“生命”的，李有建表示，陈化时间也不能太长，微生物会消耗养分。
如果生产商品化有机肥，还需要调节养分和水分达到行业标准。据了解，目前执行的农业标准NY525-2012要求总养分含量（N+P2O5+K2O）≥5%;H2O≤30%.王德汉表示，如果单纯用猪粪做原料很难达到标准，一般需要额外添加一些原辅料，如木炭灰等。或者在发酵之后添加不同比例的氮、磷、钾拌和。据了解，还可以添加功能菌，继续发酵，制成各种功能性有机肥。
据王德汉介绍，沼气池中下层沼渣也可以作为有机肥原料，但缺点是氮挥发损失多，而且含水量高。
设备投资几十万到上百万
对小规模猪场来说，一定面积的储粪池就可以进行堆肥。广东省现代农业装备研究所资源与环境工程技术研究开发中心副主任黄激文告诉记者，针对小规模猪场也有小型的发酵设备，但成本比较高，一般不推荐使用。而规模化猪场需要更大的场地和设备生产有机肥。
据李有建介绍，条垛堆肥是比较常见一种方式，把原料堆成条垛，地下埋通气管道进行间歇性鼓风供氧，每天翻堆1次。目前发酵场地3200平方，仓库1000平方，有12条堆肥线，设计年产有机肥10000吨。基建加上翻堆机，粉碎、分筛、包装设备，货车，叉车配套，总投资500多万。他告诉记者，生产10000吨有机肥大约需要堆肥原料20000吨，除掉5000吨辅料，处理猪粪尿大概15000吨，以此估算，日处理量大概55吨。
在条垛式堆肥基础上，发展出槽式堆肥，自动化程度更高。从槽的一端加料后，翻堆机每天向前移动3-4米，20天后，发酵好的有机肥从另一端出料。黄激文介绍，有机肥设备槽的深度和宽度要根据翻堆机型号来设计，可以多条槽共用一台翻堆机。以日处理量10-20吨为例，简易工棚加一台翻堆机总价大概50-60万。
塔式发酵法采用顶部提升进料，在塔内翻动、通氧快速发酵。具有占地小，封闭无味、发酵时间短等优点，但设备成本高，运行中耗电量大，运行成本也比较高。
