若要将苍蝇数量控制在较低的水平，需采取持久的卫生措施。对粪便、洒落饲料和湿秸秆每周应该清理两次，以便打断苍蝇的繁殖周期。粪便应该铺在地上晒干，或倒入粪池当中液化。杀虫剂施用方法包括有残留喷洒、无残留一次性杀灭或称接触性杀灭、捕蝇器，以及饲料添加。无论采用哪种杀虫剂，都要阅读标签，按说明操作。
残留式杀虫剂（长效）
用药水对墙壁、顶棚、栏杆以及其它苍蝇会停留的地方进行彻底喷洒，要喷到药水可以在喷洒表面流动的程度。为了把抗药性降到最低，确保灭蝇成功，不应在整个季节内重复使用有效成分相同或相近的杀虫剂（尤其是合成菊酯）。
喷洒时注意不要污染食物、饮水或器具。不要直接对着动物喷洒。喷洒二嗪磷或倍硫磷时应将圈中猪只转出。一升药液喷洒12～25平米的表面，具体用量视表面情况而定。向墙壁、顶棚以及其它苍蝇停留的地方喷洒。合成菊酯类杀虫剂和有机磷杀虫剂之间应该交替使用。上述残留式杀虫剂的药效可持续1～7周。
无残留接触式一次性杀灭（短效）
接触式一次性喷雾杀灭可迅速杀灭现有的苍蝇，但持续药效较短。必要情况下需重复采用。注意不要污染饲料和饮水。喷雾时不必将猪转出圈舍，但不要直接对着猪体喷雾。为了把抗药性降到最低，确保灭蝇成功，不应在整个季节内重复使用有效成分相同或相近的杀虫剂（尤其是合成菊酯）。应交替采用合成菊酯类杀虫剂（百灭宁、除虫菊酯）和有机磷杀虫剂（二溴磷、敌敌畏）。
捕蝇器
用装有诱饵的捕蝇器可杀灭大量苍蝇，但捕蝇器不会显著减少苍蝇的总数。另外，也没有办法通过这种方式清除苍蝇繁殖区的苍蝇。电击式捕蝇器可以减少附近圈舍的苍蝇数量。
苍蝇诱饵
可在舍内苍蝇聚集的位置分散布置，作为减少苍蝇数量的临时措施。一定注意诱饵不要放在家畜可能吃到的地方。可将诱饵放在窗台或门口等苍蝇聚集的地方。仅靠诱饵无法有效控制苍蝇数量，需与杀虫剂以及其它卫生措施相结合才可以（例如残留式喷雾或接触式喷雾）。
