一、注意勤换料、勤出料。沼气池加新料一般要在产气量高峰没有下降前，即在启动后20天，最迟不得超过30天。不是“三结合”的沼气池启动运转20-30天左右，就应添加新料出旧料，每5-10天进出料一次，每次加料量占发酵料液的3-5%，折合每天应加20千克的人、畜粪便入池发酵。“三结合”的沼气池，从启动开始就向池内进料，但应对每天进料多少作一估计，一般存栏4头猪或1-2头牛，再加入人粪尿入池发酵就可以满足需要。但要结合冲刷栏舍补充沼气池中的水量，以便保持发酵原料的浓度。
二、注意安全发酵。防止沼气细菌接触有毒物质引起中毒。如在厕所、畜栏喷杀灭虫药时，稍不注意，可能会引起沼气药物中毒，停止产气。另外，洗衣水、洗头水也不能入池。刚消过毒的畜禽粪便，喷了农药的作物茎叶，能作土农药的各种植物如辣椒、葱、蒜、韭菜等的秸秆等，均不能进入沼气池。若发生中毒，应将池内发酵料液取出一半，再投入一半新料即可正常产气。
三、注意勤搅拌。经常搅拌发酵原料能使沼气池内的发酵原料和沼气细菌分布均匀，扩大沼气细菌的接触面积，提高产气率。还可使沼气池内的温度均衡。同时又可以打破上层结壳，使中下层所产生的附着在发酵原料上的沼气，由小气泡聚集成大气泡，并上升到气箱内。
四、注意经常检查酸碱度。一般用pH试纸进行检测，正常值为6.8-7.5，也可以通过简单观察出料口料液颜色进行识别：正常发酵的沼气池出料口料液呈酱油色，且泡沫丰富；沼液略偏酸时，出料口料液泛绿，要停止进料，等恢复正常或掏出一部分原料，补充水以降低发酵浓度；如果出料口料液呈黑色且有白膜，表明料液酸化，应加入适量的澄清石灰水或草木灰，并补充更多接种物；如出料口料液呈灰色，表明发酵料液浓度偏低，应及时补充新鲜原料。夏季气温高，水分蒸发快，消耗大，要仔细观察并视情况向沼气池加注适量水，调节发酵浓度，这样有利于沼气细菌正常生活和生产。
五、注意经常检修。夏季高温，需要对混凝土沼气池进行保湿养护，常用的保湿方法是将池顶覆土保持湿润状态。当池内压力过大，应及时用气、放气，以防较大压力长时间作用于沼气，对池体造成破坏。压力大时还容易造成管道漏气，应及时作好维护。进出料口在下雨时须采取措施，防止雨水大量渗入沼气池，造成池内压力突然增大，损坏池体。正在使用沼气时，不可进出料，尤其是不能快速进出料，避免因沼气池内出现负压引起回火而爆炸。
